Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c3J3QJW5 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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