Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms