Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms