Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc8E9PWG2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms