Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms