Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms