Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms