Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms