Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
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Rrn3B2RS91 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Rrn3B2RS91 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
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Rrn3B2RS91 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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