Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms