Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
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Atp8b5A3FIN4 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms