Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GabreA2AMW3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GabreA2AMW3 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GabreA2AMW3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GabreA2AMW3 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GabreA2AMW3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GabreA2AMW3 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GabreA2AMW3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GabreA2AMW3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GabreA2AMW3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GabreA2AMW3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GabreA2AMW3 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GabreA2AMW3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GabreA2AMW3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GabreA2AMW3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GabreA2AMW3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GabreA2AMW3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GabreA2AMW3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GabreA2AMW3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GabreA2AMW3 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
GabreA2AMW3 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GabreA2AMW3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
GabreA2AMW3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GabreA2AMW3 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GabreA2AMW3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GabreA2AMW3 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms