Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms