Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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