Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms