Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Cldn9Q9Z0S7 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cldn9Q9Z0S7 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cldn9Q9Z0S7 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Cldn9Q9Z0S7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Cldn9Q9Z0S7 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Cldn9Q9Z0S7 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Cldn9Q9Z0S7 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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