Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Syt6Q9R0N8 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Syt6Q9R0N8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Syt6Q9R0N8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Syt6Q9R0N8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
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Syt6Q9R0N8 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Syt6Q9R0N8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Syt6Q9R0N8 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Syt6Q9R0N8 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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Syt6Q9R0N8 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Syt6Q9R0N8 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Syt6Q9R0N8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Syt6Q9R0N8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Syt6Q9R0N8 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Syt6Q9R0N8 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms