Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nphp1Q9QY53 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms