Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Vstm2bQ9JME9 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Vstm2bQ9JME9 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Vstm2bQ9JME9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms