Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Rabgef1Q9JM13 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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