Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pkd2l2Q9JLG4 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pkd2l2Q9JLG4 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms