Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Chrac1Q9JKP8 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms