Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms