Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

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Length 1,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Gm5845-201ENSMUST00000195812 796 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 4933427E13Rik-201ENSMUST00000044347 381 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm13215-201ENSMUST00000117559 472 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm23899-201ENSMUST00000158112 90 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm23916-201ENSMUST00000158484 399 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm17799-201ENSMUST00000183270 667 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm28809-201ENSMUST00000187542 782 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm5259-201ENSMUST00000191231 800 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm43450-201ENSMUST00000202611 632 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm45584-201ENSMUST00000211586 1143 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm9790-201ENSMUST00000054148 288 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gtf2e2-203ENSMUST00000171010 1664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Rdh7-201ENSMUST00000047199 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Fhl1-206ENSMUST00000116596 1203 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm12047-201ENSMUST00000117561 944 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm20629-201ENSMUST00000176157 513 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm18299-201ENSMUST00000192026 636 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm19058-201ENSMUST00000192135 598 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 AC114585.2-201ENSMUST00000227693 486 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 4933405D12Rik-201ENSMUST00000180557 1383 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm15419-201ENSMUST00000148654 743 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm14715-201ENSMUST00000156823 643 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm37486-201ENSMUST00000195663 405 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm43122-202ENSMUST00000202259 526 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm44805-201ENSMUST00000127648 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Faap24-203ENSMUST00000154597 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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