Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm43690-201ENSMUST00000201213 266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Eqtn-201ENSMUST00000030309 1074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms