Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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