Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxp4Q9DBY0 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms