Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pop5Q9DB28 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pop5Q9DB28 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pop5Q9DB28 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pop5Q9DB28 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pop5Q9DB28 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pop5Q9DB28 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pop5Q9DB28 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pop5Q9DB28 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pop5Q9DB28 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pop5Q9DB28 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pop5Q9DB28 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pop5Q9DB28 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pop5Q9DB28 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pop5Q9DB28 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pop5Q9DB28 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pop5Q9DB28 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pop5Q9DB28 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pop5Q9DB28 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pop5Q9DB28 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pop5Q9DB28 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pop5Q9DB28 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pop5Q9DB28 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pop5Q9DB28 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pop5Q9DB28 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pop5Q9DB28 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pop5Q9DB28 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pop5Q9DB28 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms