Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms