Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa5Q9D7I0 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms