Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Phf6Q9D4J7 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Phf6Q9D4J7 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Phf6Q9D4J7 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Phf6Q9D4J7 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Phf6Q9D4J7 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Phf6Q9D4J7 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Phf6Q9D4J7 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms