Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Snapc3Q9D2C9 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Snapc3Q9D2C9 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Snapc3Q9D2C9 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Snapc3Q9D2C9 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Snapc3Q9D2C9 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Snapc3Q9D2C9 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
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