Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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