Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms