Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Chmp3Q9CQ10 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Chmp3Q9CQ10 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Chmp3Q9CQ10 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Chmp3Q9CQ10 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Chmp3Q9CQ10 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Chmp3Q9CQ10 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Chmp3Q9CQ10 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Chmp3Q9CQ10 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Chmp3Q9CQ10 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Chmp3Q9CQ10 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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