Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NsmfQ99NF2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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