Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Ubqln4Q99NB8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Ubqln4Q99NB8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Ubqln4Q99NB8 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Ubqln4Q99NB8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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