Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms