Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm17171-201ENSMUST00000168048 534 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm44658-201ENSMUST00000207965 637 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm17799-201ENSMUST00000183270 667 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm44236-201ENSMUST00000204492 513 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm18504-201ENSMUST00000220917 929 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm14524-201ENSMUST00000121066 683 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Fam47e-205ENSMUST00000175974 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 AC102327.1-201ENSMUST00000226389 742 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm43103-201ENSMUST00000199021 802 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm34397-201ENSMUST00000213192 708 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm46339-201ENSMUST00000222720 3539 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms