Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms