Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1bQ99JY6 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms