Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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TrabdQ99JY4 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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TrabdQ99JY4 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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TrabdQ99JY4 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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TrabdQ99JY4 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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