Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smc1bQ920F6 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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