Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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