Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Top1mtQ8R4U6 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Top1mtQ8R4U6 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Top1mtQ8R4U6 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Top1mtQ8R4U6 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Top1mtQ8R4U6 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Top1mtQ8R4U6 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Top1mtQ8R4U6 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Top1mtQ8R4U6 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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