Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms