Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Lrrtm1Q8K377 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Lrrtm1Q8K377 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Lrrtm1Q8K377 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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