Protein–RNA interactions for Protein: Q8K310

Matr3, Matrin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matr3Q8K310 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Matr3Q8K310 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 203.3 ms