Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Znf628Q8CJ78 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Znf628Q8CJ78 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Znf628Q8CJ78 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Znf628Q8CJ78 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Znf628Q8CJ78 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Znf628Q8CJ78 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Znf628Q8CJ78 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Znf628Q8CJ78 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Znf628Q8CJ78 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Znf628Q8CJ78 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Znf628Q8CJ78 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Znf628Q8CJ78 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Znf628Q8CJ78 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Znf628Q8CJ78 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Znf628Q8CJ78 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Znf628Q8CJ78 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms