Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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